Otopsi işlemleri tamamlanan Aypek için Gölbaşı ilçesinin Akörençarsak Mahallesi'nde cenaze namazı kılındı.
Namaza, Aypek'in ailesi ve yakınlarının yanı sıra MHP Genel Başkan Yardımcısı Mevlüt Karakaya, MHP Merkez Yönetim Kurulu Üyesi İbrahim Çiftçi, Keçiören Belediye Başkanı Turgut Altınok, AK Parti Ankara Milletvekili Nevzat Ceylan, Gölbaşı Belediye Başkanı Ramazan Şimşek, Bala Belediye Başkanı Ahmet Buran katıldı.
Aypek'in cenazesi daha sonra mahalledeki aile mezarlığına defnedildi.
Muhsin Yazıcıoğlu Caddesi'ndeki iş merkezinde koruması ve şoförü olan Halil G'nin tabancayla ateş açması sonrası yaralanan Mehmet Aypek, sağlık ekiplerince ağır yaralı olarak kaldırıldığı 100. Yıl Hastanesi'nde 25 Nisan'da hayatını kaybetmişti.